代理申请高新技术企业认定，高新企业认证代办，办理高新企业认定政策是一项引导政策，目的是引导企业调整产业结构，走自主创新、持续创新的发展道路，激发企业自主创新的热情，提高企业的科技创新能力。对企业来说是百利而无一害的，除非企业在高新企业认定的过程中，申报材料存在造假，那就会有弊端了。
因为即使当时蒙混过关，以后一旦被查出来，问题就大了，补齐税款肯定是少不了，未来申报其他项目还会受到限制，万一被列入失信企业名单，对企业的影响那就是长远的了，完全得不偿失。
如果说真要在鸡蛋里挑骨头，非找出点弊端不可，那大概就是高新企业认定过程中要向高新技术企业标准靠拢而改变所经历的阵痛，以及高新企业认定成功后需按时填报科技、统计等政府部门要求填报的一些报表。
但不管是阵痛还是报表，都是企业要想长远发展、扩大规模的必然经历。看待事物不能只看眼前，高新企业认定也是一样，其利弊需要从企业长远发展的角度来考虑，从多个维度来思考，综合考虑之后才能得出最合适的判断。首先，高新企业认定政策的有效期只有三年，但是可以多次认定，也就是说，三年前认定的高新技术企业，如果还想继续享受高新技术企业的优惠政策扶持的话，就需要再次认定，认定成功后又能继续享受三年高新技术企业的政策扶持。
其次，在高新企业认定成功后，也不是说一定就能享受整整三年的优惠政策，高新技术企业资质是需要维护的，不然会被取消高新技术企业资格，导致被取消高新技术企业资质的情况有：
(1)在申请高新企业认定过程中存在严重弄虚作假行为的；
(2)发生重大安全、大质事故或有严重环境违法行为的；
(3)未按期报告与认定条件有关重大变化情况,或累计两年未填报年度发展情况报表的
